Protozoa merupakan mikroorganisme eukariotik. Terdiri dari satu sel (unicellular), beberapa spesies ukurannya sangat kecil sehingga dibutuhkan mikroskop untuk mengamati morfologinya dan bahkan dibutuhkan mikroskop elektron untuk mengamati strukturnya. Jumlah dan variasi protozoa sangat banyak, sekitar 46,000 spesies telah teridentifikasi dan sekitar 20,000 spesies ditemukan dalam bentuk fosil. Antonie van Leeuwenhoek, salah satu ilmuwan pertama yang mengamati mikroorganisme di bawah mikroskop, menyebut protozoa sebagai 'animalcules' seolah-olah protozoa merupakan kombinasi antara hewan (animal) dan molekul (molecule).
