ELECTRON TRANSPORT SYSTEM (SISTEM TRANSPOR ELEKTRON) - BIOCHEMISTRY

Sistem Transpor Elektron atau Rantai Transpor Elektron atau dalam bahasa Inggris disebut Electron Transport System (ETS) biasa disebut juga Fosforilasi Oksidatif (Oxidative Phosphorylation), merupakan tahap akhir 'the main event' dari respirasi sel, the last step of Cellular Respiration. Proses ini menggunakan elektron berenergi tinggi dari pendonor elektron (NADH & FADH₂) hasil dari Glikolisis (Glycolysis) dan Siklus Asam Sitrat (Citric Acid Cycle) untuk membuat ATP (Adenosine Triphosphate) terjadi di Cristae atau membran dalam pada mitokondria. 

OXIDATIVE DECARBOXYLATION OF PYRUVATE (DEKARBOKSILASI OKSIDATIF PIRUVAT)

Setelah glikolisis, pada proses repirasi sel (cellular respiration), ada dua kemungkinan yang akan terjadi. Kemungkinan yang pertama, bila TIDAK tersedia oksigen (O2) hasil dari glikolisis yang berupa Asam Piruvat (CH₃COCOOH) akan mengalami yang namanya fermentasi. Kemungkinan yang kedua, bila tersedia oksigen (O2) maka Piruvat akan  diubah menjadi Acetyl-CoA melalui proses yang disebut dekarboksilasi oksidatif (oxidative decarboxylation of pyruvate).

Pada artikel ini, kita akan membahas tentang kemungkinan yang kedua, yakni Dekarboksilasi oksidatif (Oxidative Decarboxylation of Pyruvate). Untuk yang fermentasi akan kita pada artikel berikutnya.

PYRUVATE DEHYDROGENASE COMPLEX (PDC)

PYRUVATE DEHYDROGENASE COMPLEX (PDC)

Pyruvate dehydrogenase complex (PDC) merupakan kompleks dari tiga enzim yang mentransform piruvat menjadi Acetyl-CoA melalui proses yang disebut Oxidative Decarboxylation of Pyruvate atau Dekarboksilasi Oksidatif Piruvat. PDC terdiri dari :

1. Pyruvate dehydrogenase (E1)

2. Dihydrolipoyl transacetylase (E2)

3. Dihydrolipoyl dehydrogenase (E3)

CITRIC ACID CYCLE (SIKLUS ASAM SITRAT / SIKLUS KREBS) - BIOCHEMISTRY

Siklus Asam Sitrat (english: Citric Acid Cycle) atau Siklus Krebs merupakan rangkaian proses kimiawi respirasi sel yang terjadi secara aerob di matriks mitokondria setelah proses Glikolisis. Sebelum masuk ke Siklus Krebs, mula-mula piruvat (hasil dari glikolisis) dioksidasi menjadi Acetyl-CoA dan CO₂ oleh pyruvate dehydrogenase complex (PDC). Proses pengubahan piruvat menjadi Acetyl-CoA ini biasa dikenal dengan Dekarboksilasi Oksidatif (Oxidative Decarboxylation of Pyruvate). Kemudian, gugus asetil berkarbon dua dari Acetyl-CoA bertemu dengan Oxaloacetate membentuk asam sitrat (citric acid). Karena senyawa pertama yang dibentuk adalah asam sitrat, maka siklus ini juga dikenal dengan nama siklus asam sitrat (ctric acid cycle). Produk yang dihasilkan dari siklus ini adalah 2 ATP, 6 NADH, 2 FADH₂ dan 4 CO₂.

PROTOZOA

Protozoa merupakan mikroorganisme eukariotik. Terdiri dari satu sel (unicellular), beberapa spesies ukurannya sangat kecil sehingga dibutuhkan mikroskop untuk mengamati morfologinya dan bahkan dibutuhkan mikroskop elektron untuk mengamati strukturnya. Jumlah dan variasi protozoa sangat banyak, sekitar 46,000 spesies telah teridentifikasi dan sekitar 20,000 spesies ditemukan dalam bentuk fosil. Antonie van Leeuwenhoek, salah satu ilmuwan pertama yang mengamati mikroorganisme di bawah mikroskop, menyebut protozoa sebagai 'animalcules' seolah-olah protozoa merupakan kombinasi antara hewan (animal) dan molekul (molecule).

AWESOME FACTS ABOUT DNA

Pernah dengar tentang DNA? bagi anda yang sudah lulus SMA atau yang sedang menempuh pendidikan di SMA (jurusan IPA khususnya) atau mungkin yang sedang 'iseng-iseng' belajar biologi pasti tidak asing dengan hal yang satu ini.

What is DNA?

DNA (english: Deoxyribonucleic Acid) merupakan materi genetik, zat yang kita kenal sebagai gen. Struktur DNA tersusun atas gugus phosphate, gula deoksiribosa dan basa nitrogen (purin dan pirimidin). DNA mengandung semua informasi yang dibutuhkan untuk membentuk kehidupan. James Watson, salah satu penemu DNA double helix mengatakan "there is no subtance as important as DNA", kalimat tersebut menggambarkan betapa pentingnya DNA bagi kehidupan. Well, these are some awesome facts about DNA, here they are :

CELL BIOLOGY - INTRODUCTION

Sel (english : cell) adalah unit terkecil dari makhluk hidup yang menyusun secara struktural dan fungsional (semua organisme, kecuali virus yang hanya terdiri dari DNA/RNA yang diselubungi protein, lemak atau glikoprotein). Sel pertama kali ditemukan dan diberi nama oleh Robert Hooke pada 1665. Kata cell (sel) berasal dari bahasa latin, yakni cella yang berarti ruang kecil (small room), istilah deskriptif untuk struktur biologis terkecil yang diungkapkan oleh Robert Hooke dalam buku yang diterbitkan tahun 1665 saat Hooke membandingkan struktur sel gabus (cork cell) yang ia lihat melalui mikroskop dengan ruang kecil yang ditempati para biarawan. Cabang ilmu biologi yang khusus mempelajari sel disebut sitologi (cytology).

LACTIC ACID BACTERIA (BAKTERI ASAM LAKTAT) - MICROBIOLOGY

Image source : http://textbookofbacteriology.net (L. acidophilus)

Bakteri Asam Laktat (english: Lactic Acid Bacteria) adalah kelompok bakteri yang mampu memfermentasikan glukosa (C₆H₁₂O₆) untuk menghasilkan asam laktat (lactic acid). Umumnya merupakan bakteri Gram positif (Gram-positive), komponen dasar DNA rendah akan Guanin dan Cytosin, berbentuk bulat (coccus) atau batang (bacil), tidak membentuk spora dan umumnya tidak menghasilkan katalase. 

PROTEOLYTIC ENZYMES (ENZIM PROTEOLITIK) - BIOCHEMISTRY

Image source : http://www.systemicenzymesupport.org

Enzim proteolitik (proteolytic enzymes) atau disebut juga Proteinase atau Protease, merupakan kelompok enzim yang mampu memecah rantai panjang molekul protein menjadi molekul-molekul yang lebih kecil disebut peptida (peptides) dan bahkan sampai menjadi komponen-komponen terkecil penyusun protein yang disebut Asam Amino (Amino Acid).

AMOEBA - MICROBIOLOGY

Amoeba adalah makhluk mikroskopis yang terdiri dari satu sel (unicellular). Seperti sebagian besar sel tumbuhan dan sel hewan, sel amoeba juga memiliki sitoplasma (cytoplasm), nukleus (nucleus), membran sel (cell membrane) dan ectoplasm dan endoplasma (bagian dari sitoplasma). Menurut klasifikasi Protozoa berdasarkan alat geraknya, amoeba termasuk ke dalam kelas Rhizopoda atau Sarcodina (protozoa yang bergerak menggunakan Pseudopodia).

GLYCOLYSIS (GLIKOLISIS) - BIOCHEMISTRY

Glikolisis (Glycolysis = Glucose + Lysis) adalah proses pemecahan molekul Glucose (C₆H₁₂O₆) menjadi 2 molekul Asam Piruvat (CH₃COCOOH) dengan masing-masing 3 rantai carbon (C) yang terjadi di sitoplasma (cytoplasm). Glikolisis merupakan tahap awal dari Respirasi Sel (Cellular Respiration) dan menghasilkan 4 ATP dan 2 NADH.

Pada fase awal dibutuhkan 2 ATP untuk mengubah molekul Glucose (C₆H₁₂O₆) menjadi Fructose 1,6-bisphosphate dan dengan bantuan enzim Aldolase molekul Fructose 1,6-bisphosphate dipecah menjadi 2 molekul PGAL atau Glyceraldehyde 3-phosphate. 2 Molekul Glyceraldehyde 3-phosphate inilah yang nantinya akan diubah menjadi 2 molekul Pyruvic Acid atau Asam Piruvat (CH₃COCOOH).

CELLULAR RESPIRATION (RESPIRASI SEL) - BIOCHEMISTRY

Cellular respiration atau respirasi sel secara sederhana dapat diartikan sebagai perombakan glukosa menjadi energy. Diawali dengan 1 molekul Glukosa dan 6 molekul Oksigen, melalui respirasi sel dan menghasilkan 6 molekul Karbondioksida, 6 molekul Air dan 38 ATP (Adenosin Trifosfat), dalam bentuk 38 ATP inilah energi yang nantinya akan kita gunakan untuk melakukan kegiatan sehari-hari maupun untuk metabolisme-metabolisme seluler di dalam tubuh. Ada 3 proses dalam respirasi sel, yakni :

ORCA THE KILLER WHALE (Orcinus orca)

Materi Presentasi Zoologi Vertebrata V Mammals

IUCN REDLIST STATUS : Data Deficient (DD)

Killer whale atau orca (Orcinus orca ) merupakan species terbesar di keluarga lumba-lumba dan dipercayai sebagai mamalia dengan penyebaran terluas kedua setelah manusia. Meskipun namanya Killer Whale (paus pembunuh), orca berada dalam family yang berbeda dengan paus-paus lain  (Balaenopteridae, Balaenidae, Neobalaenidae, Eschrichtiidae) melainkan masuk ke dalam family Delphinidae (dolphins/lumba-lumba).

10 MOST AMAZING SHARKS (10 HIU PALING WOW)

Hiu (sharks) merupakan kelompok ikan yang memiliki keanekaragaman jenis yang tinggi. Lebih dari 400 species hiu yang ada di lautan dengan bentuk, ukuran dan bahkan warna yang berbeda. Whale Shark atau Hiu Paus (Rhincodon typus) merupakan species hiu terbesar, yang mana dipercaya dapat mencapai panjang 59 kaki. Berikut 10 hiu paling 'wow' dengan bentuk yang tidak biasa :

White Alder or Bunga Pukul Delapan (Turnera subulata)

This is my first post with images original taken by myself :D

IUCN REDLIST STATUS : -

White Alder (Turnera subulata) atau dalam bahasa Indonesia dikenal dengan nama Bunga Pukul Delapan merupakan tanaman dari family Turneraceae. Tanaman yang berasal dari Hindia Barat ini dapat ditemukan pada ketinggian 10 - 250 m di atas permukaan laut, pada tempat-tempat yang langsung terkena sinar matahari atau yang sedikit terlindung. 

THE FIRST BIRDS : ARCHAEOPTERYX (Archaeopteryx lithographica)

Archaeopteryx lithographica adalah dinosaurus theropoda yang diyakini sebagai burung pertama di Bumi, hidup pada zaman Jurassic sekitar 150 juta tahun yang lalu. Fosil Archaeopteryx paling banyak ditemukan di  Solnhofen limestone in Bavaria, southern Germany. Pertama kali fosil Archaeopteryx ditemukan pada tahun 1861, tepat dua tahun setelah Charles Darwin menerbitkan bukunya yang berjudul On the Origin of Species.

HOW MANY SPECIES ARE WE LOSING?

HOW MANY SPECIES ARE WE LOSING?

kalau kata WWF : "well... this is the million dollar question and one That's very hard to answer". Absolutely right, kita tidak tahu pasti apa yang ada di luar sana termasuk jumlah sebenarnya dari keseluruhan species yang ada di Bumi, baik hewan maupun tumbuhan. Oleh karena itu kita tidak akan bisa tahu persis berapa jumlah species yang telah 'hilang' atau punah.

Black Woodpecker (Dryocopus martius)

Materi Presentasi Zoologi Vertebrata IV Birds

IUCN REDLIST STATUS : Least Concern (LC)

The Black Woodpecker (Dryocopus martius) adalah burung Woodpecker terbesar di daerah penyebaran geografisnya.  Ukuran tubuhnya seukuran burung gagak, kira-kira 50 cm. Species ini memiliki hubungan kekerabatan yang dekat dengan Pileated Woodpecker (Dryocopus pileatus) dari Amerika Utara (North America).

Tuatara (Sphenodon punctatus)

Materi Presentasi Zoologi Vertebrata III Reptiles
IUCN REDLIST STATUS : Lower Risk/Least Concern (LC)

Tuatara (Sphenodon punctatus) adalah spesies endemik New Zealand yang merupakan reptil purba dan telah ada sejak sekitar 200 juta tahun lalu. Hewan ini memiliki keanekaragaman genetik yang rendah, hanya ada 2 spesies, yakni Sphenodon punctatus dan Sphenodon guntheri. Pada usia 35 tahun tuatara akan berhenti tumbuh, namun hewan ini dapat hidup sampai berusia lebih dari 100 tahun. Nama Tuatara berasal dari bahasa 'Maori' yang berarti spines on back (duri di punggung).

Salamander (Caudata)

Materi Presentasi Zoologi Vertebrata II Amphibi
Salamander (Ordo : Caudata) merupakan nama umum untuk sekitar kurang lebih 500 species amphibi. Secara umum morfologinya mirip kadal, tetrapod dan berekor panjang. Sebagian besar spesies memiliki 4 jari pada kaki depan dan 5 jari pada kaki bagian belakang (seperti amphibi pada umumnya). Kulit yang lembap membuat salamander lebih suka hidup di atau dekat air, atau tempat yang terlindung dan seringkali di lahan basah. Beberapa spesies Salamander sepenuhnya akuatik (ex : Axolotl) dan sebagian akuatik saat larva namun ketika dewasa hidup di darat (terrestrial).